克痤隐酮凝胶上市后的不良反应报告显示，此药常规使用普遍耐受性良好，不良反应较少。少数患者用药部位会出现皮肤刺激，如灼烧感、红肿，或者过敏反应，如皮疹、瘙痒等。此时，应停止使用，用温水洗净，必要时向医生咨询，对此药过敏者禁用。
克痤隐酮凝胶属于外用药，禁止内服，用药期间忌烟、酒、辛辣、油腻及腥发食物。此药属于非处方药，用药前需要仔细阅读药品说明书，按照说明书推荐的剂量和疗程使用比较安全。用药七天症状无缓解，应去医院就诊，以脓肿、囊肿、硬结为主的痤疮不宜使用。如正使用其它药品，为防止药物相互作用影响治疗，请使用前咨询专业人士。