部分药物性肝损伤可以自愈，但不是所有的药物性肝损伤都能够自愈，与造成肝脏损伤的药物、损伤程度、病程以及患者自身的情况都有关系。如果在发现药物肝损伤的早期明确诊断，及时停用一些可疑的伤害肝脏的药物。而且，在基础状态较好的情况下，多数病人在停药后即可以自愈。针对于不能自愈的急性药物性肝损伤，如果能够早期的诊断，及时停药，规范、合理的保肝治疗，也能够帮助肝脏恢复，大多数患者1-2个月之内肝功能可以恢复到正常水平。
针对容易造成肝脏损伤的药物，在服药期间应该定期进行肝功检查，以早期发现，早期诊断，或者给予预防性的用药，如在应用抗结核药物时，可以预防性给予保肝药物治疗。也有少数药物性肝损伤患者可以发展成为肝硬化，甚至于肝衰竭，发展为肝衰竭的患者病死率明显增加。所以，在用药期间，尤其是针对容易造成肝脏损伤的药物，要注意观察副反应。