T3、T4偏低并不一定就是甲状腺功能减退症，因为人体在特殊情况下也可以出现T3、T4偏低情况，如在重症疾病，以及急性、慢性的消耗性疾病，患者由于处于低代谢状态，这时候会出现低T3、低T4综合征，是由原发疾病比较严重所导致。通常只需要治疗原发疾病，并不需要针对单纯的低T3、低T4来进行处理。
如果患者出现T3、T4偏低，而且促甲状腺激素即TSH明显升高，这时候才要考虑甲状腺功能减退症的可能。通常需要针对甲状腺功能减退症，使用左甲状腺素钠进行替代治疗，通过定期调整剂量，T3、T4会逐渐恢复到正常，TSH水平也会逐渐回落到正常。另外针对出现的甲减，最好做出病因的判断。