腱鞘囊肿做小针刀，术后的复发机会是比较多的，小针刀可以在皮下将囊肿壁切断，囊肿破裂之后囊肿内的液体会渗到皮下囊肿基本就消失了，但由于囊肿的根部与关节囊还是相通的，关节内的积液还能够通过相通的部位进入到皮下组织，容易形成新的囊肿。
小针刀虽然可以切破囊肿，但不能解决囊肿与关节腔相通的问题，因此有一定的复发率，更好的方法是在麻醉下进行囊肿的切除，切掉囊肿的同时再把关节囊薄弱区进行加强缝合，这样就断绝了关节腔与囊肿的交通，以后出现复发的机会就比较小了。
治疗的效果，尤其是对于预防复发的角度来说，手术切除比小针刀要更好一些。