在二期梅毒时会出现关节疼痛，梅毒扩散到全身之后可以引起斑片状的脱发、肌肉酸痛或关节肿胀、发烧、咽喉痛、淋巴结肿大、视力下降、看东西模糊。此外患者还可以出现神经损害，表现为头痛、呕吐、嗜睡、反应迟钝等。
二期梅毒的主要的临床表现就是梅毒疹，梅毒疹可覆盖全身的皮肤和黏膜，甚至手掌、脚底都出现梅毒疹。梅毒疹可以是红色、红褐色的丘疹、斑丘疹、斑块等，与普通的皮肤病类似，通常不会发痒或者是仅有轻微的瘙痒，有的皮肤黏膜上可以出现脓疱、溃疡，溃疡可能发生在口腔、咽喉或者是生殖器上，皮疹通常在2-3个月后可以自行消退。