肠镜主要分为结肠镜、小肠镜、普通肠镜、无痛肠镜。出现大便习惯改变或者是长期出现腹痛、腹泻的症状时，可以通过肠镜检查的方法进行确诊，进行肠镜检查时可以根据肠道病变选择合适的方法。
对于出现腹泻、便秘的患者，可以使用结肠镜进行检查，结肠镜可以针对结肠、直肠等部位进行观察，主要用于结肠、直肠疾病的诊断或治疗。当出现营养吸收不良时，表明病变部位处于小肠部位，这时应当选择小肠镜方法进行检查，在进行肠镜检查时，对于疼痛耐受力比较强的患者，可以选择普通肠镜。
但是有不少人对疼痛耐受力比较弱，这类患者可以选择无痛肠镜，无痛肠镜是在静脉麻醉状态下进行的检查，因此整个检查过程不会出现不适感。