通过鼻内窥镜检查，也能够查出鼻窦炎的病情。在鼻窦发生急慢性炎症时，鼻窦腔内炎症性分泌物，容易通过各个鼻窦窦口溢出到各个鼻道内。鼻内窥镜下往往可以观察到中鼻道，以及嗅裂区域出现较多黏脓性分泌物，能够根据炎症分泌物所处位置，大概判断出发生炎症感染的鼻窦范围和区域。
对于少部分程度较轻的鼻窦炎症患者，或者处在缓解期慢性鼻窦炎患者，鼻内窥镜检查可能不会出现阳性表现，可以进一步结合鼻窦CT检查综合判断。部分鼻窦炎患者，还可能会进一步出现鼻息肉，通过鼻内窥镜检查也能够观察到。