吉兰-巴雷综合征病人最大危险是出现呼吸肌麻痹，患者可出现呼吸困难，不能自主呼吸，主要是疾病累及肋间肌和膈肌，导致患者呼吸肌麻痹所致，患者可能需要呼吸机辅助呼吸。对于此类患者，要密切观察患者呼吸情况，保持呼吸道通畅。如果出现呼吸衰竭或气道分泌物过多，应该及早进行气管切开，及早使用呼吸机。
对于卧床患者，要加强护理并帮助活动，预防继发性感染。因此，吉兰-巴雷综合征患者最大危险是出现呼吸肌麻痹。除了给予呼吸机支持外，还要给予丙种球蛋白治疗或大剂量激素。对于重症吉兰-巴雷综合征患者，往往还会给予血浆置换治疗。