淋球菌感染主要是引起淋病，这是一种常见的性传播疾病，由于淋球菌对于头孢等抗菌素是高度敏感的，所以感染了淋球菌之后，首选采取头孢曲松钠，也叫头孢三嗪进行治疗，通常早期的淋病，一次性的肌肉注射或者静脉注射就能治愈。
此外，大观霉素对于淋球菌也有很强的杀灭作用，可以选用。像喹诺酮类的抗菌素，比如左氧氟沙星，还有大环内酯类抗菌素，比如阿奇霉素以及四环素类的米诺环素、多西环素等，也能够有效的抑制淋球菌，也是可以选择的。但是以前曾经作为首选的青霉素，目前已经广泛产生了淋球菌的耐药，所以对于大多数淋球菌感染效果已经不好了，通常不再选用。