前列腺囊肿有先天性和后天性两种，常见的是先天性囊肿，先天性囊肿可以分为前列腺囊上的前列腺囊囊肿，以及发生在前列腺实质内的前列腺囊肿，前列腺囊囊肿发生率明显高于前列腺实质内的前列腺囊肿。
多数前列腺囊肿患者不需要特殊治疗，但是如果引起明显的临床症状且症状顽固，经保守治疗无效考虑手术治疗。
手术具体的处理方法是，对于较小的前列腺囊肿考虑经会阴或经直肠抽吸囊肿，但该治疗方法容易造成感染和复发。
对于较大的前列腺囊肿可以手术切除，手术的途径可以经耻骨后或会阴，有人主张底肌路径暴露较好，有利于手术完全切除囊肿，如果囊肿突出到膀胱内可经膀胱切除。