肛瘘最为明显的表现症状是在直肠肛门，以及周围皮肤上，出现一条连通的管道，并且管道会出现较多分泌物。尤其是在用手挤压管道或肛门时，会发现从肛门，以及周围的皮肤上会渗出黏液。肛瘘症状会引起肛门周围出现明显的瘙痒，由于分泌物的增多会对肛门周围的皮肤形成一定刺激，从而引发皮肤瘙痒，严重的还会形成肛周湿疹。肛瘘会在肛门周围形成脓肿，由于大量的组织液或脓液从肛门处渗出，聚集在肛门周围的皮肤处，最终会形成肛周脓肿。脓肿外表质地较为坚硬，用手按压会有明显的疼痛。除这些症状之外，肛瘘还会引发患者出现便血，以及粪便从裂口处渗出。