支气管管镜检查一个目的是用于诊断，另一个目的适用于治疗。
用于诊断主要见于支气管内的恶性肿瘤，也就是肺癌，通过做支气管镜可以看到支气管内的肉芽肿组织，通过活检来明确诊断。
另外支气管内的结核也是通过支气管镜检查明确诊断，还有咯血的病人，不明原因的咯血可以通过支气管镜检查来明确肺部咯血的部位。
同时还有一部分感染不能明确诊断又无法咳嗽的病人可以通过做支气管镜肺泡灌洗来明确诊断。
对于治疗，如果是支气管结核的病人可以通过做支气管镜下治疗注射结核药物来治疗，这是其支气管镜的治疗作用。