牙周炎不会经常引起口腔溃疡，因为二者的病因不同，牙周炎是一种由细菌感染引起的牙槽骨吸收，牙龈红肿、疼痛的疾病，目前认为牙周炎主要是和牙龈卟啉单胞菌、伴放线聚集杆菌、变形链球菌、血链球菌、嗜酸乳杆菌、黏性放线菌等细菌感染有关。
经常出现的复发性阿弗他溃疡目前病因不清，存在着明显的个体差异，认为可能和免疫功能降低、遗传因素、全身系统性疾病伴发某些细菌感染，如L型链球菌，和地理环境、社会环境、维生素、微量元素缺乏等有关。还有一种经常发生的创伤性口腔溃疡，是因为局部有尖锐的牙尖、边缘嵴、牙石、残根、残冠、不良修复体等机械刺激，反复摩擦口腔黏膜造成，和牙周炎无关。