正常的跑步运动一般并不会引起肾疼痛的。造成跑步时肾痛的原因主要有以下几个：一、肾脏存在结石，肾脏里面结石会因为跑步与肾盂黏膜壁相互摩擦，引起局部疼痛，严重时可能会造成血尿，还有肾绞痛症状。二、肾下垂引起的，肾脏下垂通常是身体比较瘦弱的人容易出现，肾下垂的患者在进行剧烈运动时容易出现肾区疼痛，一般休息一段时间就会恢复正常。三、剧烈运动时，也可能是腰肌部位引起肌肉拉伤而造成疼痛，并非肾本身疼痛。跑步时引起肾痛的因素，大多数与肾脏方面的病变有关系，但也不能排除是其临近器管发生病变诱发引起。