功能性蛋白尿也就是平常所说的生理性蛋白尿，可以见于某些特殊的情况而出现的蛋白尿，这种蛋白尿在度过特殊时期以后会消失，比如病原微生物进入机体后造成的炎症性疾病，患者出现体温升高，特别是体温>38.5℃时，有些人会出现尿中蛋白，这种蛋白尿在体温正常以后就会消失。
还可能是过度劳累、过度饮酒，或者夜间长期不能休息后，尿中可以出现蛋白质。但通过充分的休息或者戒烟、戒酒后，这种蛋白尿会明显的消失。有些情况比如女性月经期可以出现蛋白尿，当度过月经期后蛋白尿就会消失。有些比较瘦弱的人，也就是体型比较瘦弱的人，可以出现胡桃夹综合征，此时尿中可以出现蛋白尿。当体型变肥胖后，也就是随着年龄的增长，腹部脂肪逐渐增多，胡桃夹综合征就会消失，尿中蛋白质也会消失。