耳朵不舒服到耳科门诊就诊，首先要检查外耳的情况，包括耳廓有没有红肿、包块、疖肿，外耳道有没有湿疹、脓液、耵聍，然后再检查鼓膜是否完整，有没有穿孔、充血，如果看不清楚可以行耳内镜下检查，这样能够更好的看清楚鼓膜的具体情况。
如果是听力出了问题，要行纯音听阈测听和声导抗检查，这是耳科最常见的两项检查，能够判断现在听力的具体情况，是传导性耳聋、神经性耳聋，还是混合性耳聋。声导抗可以提示鼓室是否有负压，鼓室是否有液体，以及镫骨肌反射情况。
如果是长时间耳部流脓，还要行耳部CT检查，明确乳突及鼓室、内耳的具体情况。如果内耳有肿瘤生长，还要配合耳部核磁检查。