小朋友嘴巴磕破肿了，要根据伤口的深度来决定处理的方式，就诊的科室一般推荐口腔外科，尤其是小儿口腔外科就更好，具体处理如下：
1、清创、促愈合：如果只是皮肤破裂一点点，没有造成贯通伤，处理比较简单，一般用聚维酮碘、碘甘油来清洁、消毒创面，一天大概2-3次，具体用药周期以嘴巴创面的恢复来决定，可以用康复新液、重组人表皮生长因子进行创面喷洒，来促进创面愈合，一般创面愈合以后，肿就会好很多。
2、清创缝合术：如果很严重，是比较大口子的贯通伤，出血比较多、难以止住，又怕留下疤痕，可以做皮肤、口腔黏膜的清创缝合术，一般要求在伤后24小时之内就诊。