附睾炎在临床治疗上，既可以使用头孢，也可以使用左氧氟沙星，但两个药不能联合使用。由于附睾炎常见的病因，是由于大肠杆菌导致的附睾炎症，无论是头孢菌素还是左氧氟沙星，抗菌谱都可以覆盖这些附睾炎常见的致病病原体。
在临床中会结合患者有无药物过敏史，比如患者有头孢、青霉素过敏史，不建议使用头孢。如果患者年龄偏小，比如小于18岁，不推荐使用左氧氟沙星，因为会影响骨骼的发育。对于高龄的患者，比如大于80岁以上的老年男性，一般不常规推荐左氧氟沙星，因为引发神经系统的副作用的概率会大大上升。