大动脉错位手术的后遗症有：一、行大动脉错位手术的病人，可能会出现的后遗症有肺动脉压力发生变化，出现急性或者慢性的右心衰竭，出现气急、呼吸困难、双下肢水肿、肝脾增大、腹腔积液等症状；二、还有可能出现休克，比如低血容量性休克，因为手术过程中出现某血管尤其是动脉破裂，失血量过多，就有可能出现低血容量性休克，危及生命。再比如心源性休克，心脏经受大手术后，可能长时间恢复，心功能不能满足机体需要，出现休克；三、还有可能出现肾功能不全，出现尿量减少、双下肢水肿等后遗症，需要临时透析治疗。