膝关节炎打玻璃酸钠的坏处是导致膝关节内细菌性感染，膝关节关节腔是对细菌抵抗力比较弱的环境，尤其是在发生关节炎的改变后，更容易发生细菌的感染，打玻璃酸钠时需要每周进行一次关节穿刺，有可能会把体外的细菌带入到关节内，产生关节内的化脓性关节炎，这是打玻璃酸钠的坏处。
为什么要打玻璃酸钠，是因为对于膝关节炎的病人关节疼痛和活动受限是常见的问题，玻璃酸钠注射常常会缓解关节炎的症状，改善活动范围，提高生活质量，因此很多病人都会接受玻璃酸钠注射。一般一个疗程是注射五针，每针间隔一周，为了治疗膝关节炎可以打玻璃酸钠，但要进行严格的无菌操作，降低发生感染的风险，要到正规医院进行规范的操作才能保证安全。