95%以上输卵管妊娠患者，以腹痛为主要主诉就诊。输卵管妊娠在没有破裂时，增大的囊胚可能会使输卵管膨胀，导致输卵管痉挛，甚至发生逆蠕动，此时患者疼痛多为隐痛或胀痛。而输卵管妊娠出现破裂时，一般腹痛症状表现为撕裂样剧痛，疼痛多为持续性，有时偶尔会有阵发性发作。
当血液积聚在子宫直肠窝，可能会出现肛门坠胀感，也就是里急后重。出血多时可能会出现全腹疼痛，甚至血液刺激横膈，引起肩胛部放射痛。所以宫外孕腹痛症状需根据输卵管妊娠状态，是未破裂还是破裂，或是发生了流产等综合进行判断。90%以上输卵管妊娠患者都会有腹痛症状，有时症状比较轻微，有时症状比较剧烈，甚至疼痛时会有血压下降等休克表现。