环丙沙星和左氧氟沙星相比，治疗尿路感染时更加首选左氧氟沙星。环丙沙星属于第二代喹诺酮类抗生素，而左氧氟沙星属于更新一代。在实际治疗过程中，两个药物对覆盖的细菌大致差不多，但左氧氟沙星副作用会明显更低，而且杀菌浓度会更强。所以从理论上来讲，左氧氟沙星比环丙沙星更优。
尿路感染常见致病菌，如大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和变形杆菌，通常都是首选喹诺酮类抗生素。但如果在治疗起初，采用相对更加高效、低毒药物，比如三代喹诺酮类，在临床上一般会取得更优疗效，能够减少疾病转为慢性感染的可能。