鼻窦炎要根据病因决定怎么样治疗最好，常见的鼻窦炎分为急性的和慢性的两种。还根据病原体是由什么因素引起的，分为好多种其他特殊类型的鼻窦炎，最好的治疗鼻窦炎的方法是要先明确诊断是哪一类型的。
比如最常见的感冒引起的鼻窦炎属于急性的鼻窦炎，是细菌或者病毒感染引起的鼻窦炎，越早治疗效果越好。如果治疗不彻底，可能会变成慢性鼻窦炎，可能要治疗时间相对的延长，有的甚至会用药3-6个月，才能完全彻底治好。
特殊类型的鼻窦炎，即便是用药仍然无效，需要考虑做手术，做手术治疗鼻窦炎的还算是少数。
但是有些鼻窦炎就算是做了手术，仍然有可能反复的发作，反复的需要手术的介入和药物治疗，那时可能需要综合的治疗，而不是单纯一种药的两种药的治疗，才能解决这种复杂的问题。
要是医生建议鼻窦炎需要做手术的时候，需要注意围手术期的治疗，某些药物能可能术前就要用，术后仍然要坚持用一段时间才可以停药的，否则，药效就会不稳定，效果也不会太好。