脑炎根据不同的致病菌可分为病毒性脑炎、细菌性脑炎、结核性脑炎和真菌性脑炎，一般要根据不同的致病菌来判断病情的危重。
病毒性脑炎如非特异性病毒所引起的脑炎，患者可能在临床上只是表现轻微的低热、头疼，经过治疗以后可以完全恢复，不留任何后遗症状。但如果是单纯疱疹性病毒性脑炎或者自身免疫性脑炎，患者往往会有精神症状或者癫痫，甚至出现意识障碍，病情比较危重。
结核性脑炎、细菌性脑炎和真菌性脑炎的病情相对都比较危重，治疗上也比较棘手，因此脑炎是否严重关键要看是何种病原菌感染。