屁股沟痒需查明病因方可进行药物治疗，如果是由于湿疹引起的肛门瘙痒，可以使用复方炉甘石洗剂进行止痒，使用曲安奈德软膏、可的松软膏、肤轻松软膏涂抹进行治疗。如是由痔疮引起的肛门瘙痒，可以使用马应龙痔疮膏、肛泰软膏肛门区外用，消肿止痒。
如果是由肛门周围炎症反应引起的红肿、瘙痒，可以使用红霉素软膏、金霉素软膏，或派瑞松软膏肛门涂抹，消除肿胀、止痒。真菌感染引起的瘙痒，可以使用抗真菌药物进行治疗，如水杨酸软膏、复方苯甲酸软膏、硝酸咪康唑软膏、酮康唑乳膏、克霉唑乳膏等，对真菌有很好的杀菌作用。