手足口病的患者不一定都需要住院治疗，轻症的患者一般居家隔离治疗。患者一般是对症处理，缺乏特效的抗病毒药物，要注意卧床休息，多饮温开水，饮食应清淡、易消化，避免刺激性的食物。如果患者体温达到38.5℃以上，可以应用物理降温、药物降温，常用的降温药物包括对乙酰氨基酚、布洛芬。如果局部的皮疹有破损，可应用龙胆紫进行局部涂抹。
患者如果合并了并发症，比如合并肺炎、心肌炎、脑炎，这种情况病情偏重，一般需要住院治疗。住院治疗的患者也是采取对症治疗的措施，如果有脑炎，一般要进行脱水。如果有局部的肺炎、呼吸困难，还需要进行氧疗，必要的时候还需要插管，进行呼吸机的辅助支持治疗，因此对于重症的患者需要住院治疗。