大便有真菌与肠道受到真菌感染、长期服用抗生素等因素有关。真菌是一种条件致病菌，不仅会让人体呼吸道、阴道部位存在，部分真菌也会在口腔、消化系统中存在。在人体出现免疫力下降时，消化系统中的真菌就会逐渐繁衍增生，从而造成真菌感染。这些人在大便时，一部分真菌会伴随着粪便一起排出体外，因此在进行大便常规检查时，能够发现大便中有真菌的存在。部分人在患有疾病时，会使用抗生素药物进行治疗，抗生素的长期使用会导致肠道微生态失衡，因此会更容易出现真菌感染。在对粪便进行检查时，会发现粪便中存在真菌。对于真菌感染的患者，需要停止抗生素使用，适当服用肠道益生菌，提高肠道功能，促进肠道有益菌滋生，以帮助改善病情。