溃疡性直肠炎灌肠用药和一些口服药基本上差不多，主要分为西药和中药。西药主要有三大类：第一类，柳氮磺胺嘧啶类的药物，如美沙拉嗪。第二类，激素类的药物，比如布地奈德。第三类，免疫抑制剂，比如甲氨蝶呤等。
还可以选用一些中药灌肠，具体的中药建议到正规的专科医院，找专业的中医医师进行处方开药。溃疡性直肠炎容易反复发作，控制病情比较困难，所以要积极配合治疗，调整生活状态，积极加强正面战胜疾病的信心，可以帮助患者减少复发。