大便时肚子疼应该是由于肠痉挛、急性肠胃炎、细菌性性痢疾、胃肠功能紊乱这些原因所导致。通常情况下人的直肠粪便积聚到一定的量时，会刺激肠道加快蠕动排出大便，肠道在蠕动过程中一阵一阵的引起肠平滑肌痉挛，所以会引起肚子痛，排便之后肚子疼痛就会消失。
如果吃了过多辛辣、刺激性的食物，或者吃了不卫生的食物，引起急性肠胃炎，由于炎症因子刺激肠道，也会出现大便次数增加、腹痛等不适。细菌性痢疾患者由于肠道内有大量的细菌感染，刺激肠道黏膜流动加快，导致大便次数增加，大便性状变稀、腹痛，存在胃肠功能紊乱的患者，由于胃肠道消化吸收功能下降，会出现排便时肚子痛。