仿真结肠镜检查实质上是影像学检查，随着医学影像技术不断进步，影像学操作可以通过重建恢复肠管内的内壁结构。检查其痛苦性较肠镜是明显减低的，但是在检查之前，患者也要接受清肠等临床操作。
但是仿真肠镜大多和真实的肠镜仍然有一定的诊断效率差别，因为尽管X线能够看到全肠道病变，但是由于是合成影像，有些小的病灶仍然容易被漏诊，而且仿真肠镜不可能为可疑病灶取病理活检。因此，仿真肠镜和真实的肠镜仍然有着较大差别，如有可能，还是建议患者进行真实的肠镜检查。