疟疾病的治疗，包括抗疟原虫治疗、基础治疗以及对症治疗，一般情况如下：
1、抗疟原虫治疗：是最重要的治疗，选药原则根据诊断是否为恶性疟疾、血中原虫密度大小、患者病情的轻重，患者是否来自耐药流行区域、当地疟原虫的耐药类型、当地药物的可及性来选择药物。常用的药物，包括杀死红细胞内液体增殖期疟原虫的药物，主要用于控制临床发作，可以选择青蒿素及其衍生物、氯喹等，杀灭红细胞内疟原虫配子体，和肝细胞内迟发型子孢子的药物，主要是防止疟疾的传播与复发，可以选择磷酸伯氨喹。
2、基础治疗以及对症治疗：发作期及退热后24小时患者要卧床休息，注意补充水分，对食欲不佳者给予流食或半流质饮食，恢复期给予高蛋白饮食，适当补液，贫血者可以给予铁剂治疗。脑型疟疾患者常出现脑水肿与昏迷，应及时给予脱水治疗，监测血糖以发现和纠正低血糖，应用低分子右旋糖酐，有利于改善微血管堵塞，可以提高脑型疟疾患者的治疗疗效。