脂肪填充可能会造成抽脂部位或者填充部位的出血、血肿及瘀斑，也有可能填充脂肪的液化而造成感染的情况。由于医生的操作不当，会造成填充部位皮肤的凹凸不平、感觉神经的受损，有可能出现局部的麻木等。这些情况随着时间推移，都可以逐渐的减轻或者消退。
如果脂肪填充面部，面部血管比较丰富的部位，像鼻根部、额部以及双侧的颞部。如果填充的脂肪颗粒进入到血管内而造成血管栓塞，会引起比较严重的并发症，会造成局部的皮肤坏死或者视力的减退、消失，也可能脑血管的意外情况。