做肠镜前的准备工作主要包括肠道准备，要喝一些泻药把肠道内容物彻底清理干净，使肠腔没有其他的大便等等。
在做肠镜时可以清楚观察到肠道黏膜的情况，有无肿瘤、息肉、炎症、溃疡等等。
肠道准备之后还需要在做肠镜前抽血化验传染四项来确定有无传染病，同时还需要检查凝血功能是否异常。
如果凝血功能有异常的要停止做肠镜，如果有传染病的要针对性使用相应肠镜，在做完后肠镜后做单独的消毒处理。