肝移植如果出现排斥反应，有可能导致移植器官的失效，从而出现死亡的情况，但因为现今对于免疫抑制药物的进展，所以肝移植的排斥反应较为少见。
肝移植排斥反应可以分为超急性排斥反应、急性排斥反应以及慢性排斥反应，目前针对肝移植排斥反应，药物主要是用强的松、激素进行冲击治疗，此外也要使用FK506或者环孢素A进行免疫的控制，防止肝移植的排斥反应。
如果出现肝移植排斥的反应，患者会表现为发热、乏力、嗜睡、食欲减退、肝区压痛、大量的腹水，胆汁的引流可能会变得稀少、稀薄，而且血液学的检查也会出现肝功能的明显异常，确定的诊断可以通过肝活检来进行确诊。