遗精后疼痛，最常见于慢性前列腺炎病人。病人发生慢性前列腺炎时，由于感染性致病微生物会沿精液传播，引起精液感染，在射精后精液进入后尿道时，会导致后尿道黏膜水肿、糜烂，会出现射精后尿道不适或尿道疼痛症状。
病人出现上述症状时，需及时到泌尿外科就医。通过精液细菌培养，通过精液支原体、衣原体培养可以找到致病微生物，通过选择有效的抗生素和中成药物联合治疗，多数病人遗精后疼痛症状会明显好转。