胡桃夹综合征的治疗主要有保守治疗和手术治疗两种办法，保守治疗主要用于镜下血尿或间断短时无痛、肉眼血尿症，不伴有贫血，可严密随访，不必进一步治疗，因为随着年龄的增长，可以等待侧枝循环的建立，另外一个肠系膜上动脉起始部周围脂肪结缔组织的增厚，也能够缓解梗阻症状，因此最好是保守观察。
由于某些诱因，如剧烈运动、感冒，可以诱发血尿，应该避免剧烈运动及预防感冒，手术治疗的适应症是经两年以上观察或者内科对症治疗，症状无缓解或加重，还有肾功能损害及出现并发症，手术的目的是解除左肾静脉压迫，因此手术方式并不固定，包括肠系膜上动脉与腹主动脉的端侧吻合术、自体肾移植术、左肾静脉下移术等，介入治疗主要是为左肾静脉内支架置入术，不过该治疗有支架脱落变形、再次狭窄、血栓形成的并发症，而且需要长时间的抗凝指导，且价格昂贵，因此不是主流的治疗方式。