确诊飞蚊症后先需要明确飞蚊症的原因，是否合并有眼部的器质性病变。如果通过详细的眼前节及眼底的检查，已经排除了眼部的器质性病变，飞蚊症不需要进行特殊的治疗，不会引起眼睛的任何并发症。
如果飞蚊症可以找到病因，需要看这种病因是生理性的还是病理性的。很大一部分人群中，比如老年人，高度近视眼患者，这些人里很多都会有飞蚊症的症状，因为玻璃体液化造成，也不需要特殊的治疗，就像人老了皮肤会出现皱纹是一样的。
在这两大类人群中很容易出现玻璃体的液化，如果飞蚊症是因为病理改变比如眼底视网膜的出血、视网膜裂孔等，需要进一步的治疗。