手关节囊肿最好发的部位是发生为手腕的背侧，偶尔在手腕的掌侧偏拇指一侧也会有发生，这种囊肿基本上都是由于腕关节内的关节液渗透到皮下形成的。
治疗方法包括两类，一类是保守治疗，如果囊肿没有太大，没有明显症状可以不管，一般囊肿不会持续性的长大，有时随着活动减少会逐渐吸收。
如果有症状或者是影响外观可以进行去除，在囊肿比较坚硬的时候可以用手挤破囊肿，囊肿液吸收之后囊肿消失了。
另一类方法是在手术麻醉之后，做手腕的横行切口显露囊肿，完整剥离之后切除囊肿，并将囊肿与腕关节的关节腔交通的部位的关节囊进行加强缝合，能够最大程度的避免囊肿的复发。