超声胃镜和普通胃镜都是检查胃部病变的方法，两者的区别很大，普通胃镜主要是观察食管、胃、十二指肠黏膜的病变，看不到黏膜下层的病变。超声胃镜既可以观察到局部黏膜病变，也可以观察到黏膜下层的病变，了解黏膜下层有无肿块、肿块大小，初步判断肿块的性质，但不能进行病理活检取材和超声胃镜下的治疗。普通胃镜可以直观地观察黏膜层病变，可取病理活检或进行多种内镜下治疗。
两者各有优缺点，要根据病变情况选择检测方法或联合检测，取长补短，提高临床诊断水平，以期更早、更精准的发现、治疗疾病。