丙肝合并慢性肝损伤的患者，目前90%的患者可以得到彻底的治愈。随着药物研究的发展，目前对于丙肝合并慢性肝功能损伤，通过抗病毒药物的治疗，主要是蛋白酶抑制剂联合干扰素进行规则治疗三个月以后，绝大多数的患者病毒载量完全清除。
在病毒载量清除的前提下，病毒对肝细胞的损伤可以终止，肝脏的纤维化可以得到全部或者部分的恢复，患者的肝功能、肝硬化程度得到不同程度的缓解。
目前认为丙肝合并慢性肝功能的患者治疗效果比较好，绝大多数的患者可以获得完全性的应答，而在临床上判定为彻底痊愈。