体外微波治疗仪的作用有促进炎症吸收，由于受热可引起血管扩张和血液循环加速，可以加速炎症细胞的吸收，还可以杀菌消灭致病微生物，可以加快致病微生物以及毒素的排泄。具有止痛的作用，能够降低感觉神经纤维的兴奋性，从而止痛。
体外微波治疗仪还具有增强体内抗体的免疫作用，增强吞噬细胞的功能，有一定的增强免疫功能的作用。
泌尿科可以用于治疗前列腺炎、前列腺增生，有效率能够达到90%以上，针对女性泌尿生殖系统的炎症也有一定作用，是一种无创的治疗方法，病人没有痛苦，需要结合药物治疗，这是一种物理治疗。