两个月宝宝脑炎反复发烧，在处理上主要分以下几方面：
1、针对发热做相应对症退烧处理，两个月孩子通常还不能使用退烧药，所以对于发热一般采取物理降温方式，比如减少衣服、被子，也就是所谓开包降温，降低所处环境温度，包括可以适当洗温水澡或温水擦浴等，都有助于体温下降。
2、对于孩子发热，如果是因为脑炎引起，在脑炎彻底治愈之前，反复发热可能会持续存在。所以最根本还是针对脑炎做相应对因处理，也就是积极处理和治疗脑炎，比如大部分可能是化脓性脑膜炎，和细菌感染有关，要积极进行抗感染治疗。随着脑炎恢复，通常也会随之彻底退热。