中医治疗间质性膀胱炎需要根据辨证进行施治，按照辨证可分为热淋、血淋、气淋、膏淋、劳淋等范畴。按照病证分型治疗热淋，通常应用清热解毒、利湿凉血，推荐的方药是八正散和二妙散化裁。
气淋通畅之法是疏肝行气，主要的方药是沉香散，中气不足的可以使用补中益气汤。血淋应当清热利湿、养血止血，主要的方药是小蓟饮子。劳淋主要的治法是健脾益肾，应用无比山药丸加减，膏淋应用清热利湿、分清泌浊，主要方药是程氏萆薢分清饮加减，其他的中医治疗还包括了针刺疗法、足浴疗法、坐浴疗法等。