宫颈癌甲基化主要是从分子水平上进行宫颈预测，看有没有基因突变、抑癌基因异常，而且导致肿瘤进展过程出现问题没有，通过DNA甲基化能早期判断出恶变情况，而TCT就不是这样。
TCT是细胞水平上判断良性、恶性，可能会稍微晚一些，肯定要比甲基化出现病灶晚。因为甲基化是DNA水平，而TCT是蛋白质细胞水平。TCT是通过采集宫颈口脱落细胞，进行显微镜下观察，判断是良性、恶性。虽然比甲基化略晚，但同样是早期诊断、早期确诊宫颈癌的重要手段。宫颈癌甲基化不常用，但TCT是目前最常用的早诊手段。