腱鞘囊肿手术治疗方法如下，单囊型囊肿可在局麻下切除，但最好在臂丛麻醉下，并且用止血带后进行手术，这样可以清楚识别多囊型或长蒂型囊肿，彻底全部切除，以减少复发率。
对桡动脉附近的囊肿，应仔细分离血管、神经，避免损伤。腕背侧腱鞘囊肿，先在腕背以囊肿为中心做一横切口，切开皮肤后显露囊肿，沿囊肿周围分离至囊肿基底部，显露该部位的韧带和腱鞘，注意有无小囊肿。
将囊肿蒂部连同其基底部的病变组织及周围部分正常的腱鞘、囊蒂彻底切除，再止血、缝合皮肤，其他的腱鞘囊肿与腕背部腱鞘囊肿类似。