一般引起婴幼儿的鹅口疮反复发生的原因，主要包括以下几个方面。首先，由于奶瓶消毒不严格引起，因为部分儿童的鹅口疮，是由于奶瓶没有消毒完善，从而引起白色念珠菌滋生引起。
如果家长一直没有注意这个情况，奶瓶消毒不彻底就会出现反复的鹅口疮。其次，由于儿童肠道菌群紊乱引起的症状，患有肠道菌群紊乱以后，也会引起反复的真菌性感染，从而造成鹅口疮。
此外，由于儿童应用免疫抑制剂引起，如果应用糖质激素等免疫抑制剂过长，可引起免疫力的下降，也会造成反复的真菌感染，继而引起反复的鹅口疮。