囊腺性膀胱炎手术一般采用经尿道膀胱病损切除手术，其恢复期大约为7-14天左右，需要根据术后排尿的颜色及患者自身改善的症状来进一步的决定。原则上来讲膀胱黏膜修复的时间大约为一周左右，但是如果病损的范围过大、手术的范围过大，恢复的时间可适当延长5-7天左右。手术以后如果患者没有排尿出血的现象，小腹部疼痛的症状完全消失，则提示已经初步恢复，术后患者一般可以进行正常的饮食和正常的活动。
但是如果手术以后出现持续性的血尿，间断性或持续性的小腹部隐痛不适，则提示膀胱黏膜未完全恢复至正常状态，此时可能仍然需要进行持续的膀胱冲洗，给予一些预防感染的药物、膀胱灌注的药物等促进其恢复。绝大多数的情况下，患者于7-14天左右基本可以达到良好的恢复，极少数患者可能存在恢复延迟的现象。