自闭症的治疗主要是以教育干预为主，药物治疗为辅。因为自闭症的孩子存在多方面的发育障碍以及情绪、行为异常，需要医生根据孩子的具体情况，采用教育干预、行为纠正，以及药物辅助治疗的综合治疗措施，而且不同的孩子我们要进行个体化治疗。
在教育方面，首先医生、老师和家长要取得一个共同的认识，要知道孤独症的治疗，也就是自闭症的治疗是一个长期慢性的过程。家长要拿出足够的时间来陪伴孩子，跟孩子增加亲和度。同时要及时领孩子到户外运动，多与同龄的孩子进行沟通和交流，增加孩子社会交往的能力。同时针对孩子各方面发育的异常，进行针对性的感觉统合训练。如果孩子有其它伴随症状，比如有多动症或者抽动症，可以配合相应的药物治疗。