男性在射精时尿道有烧灼感考虑泌尿系统受到感染引起的。一旦尿道内存在炎症如尿道炎、前列腺炎等，会对尿道的黏膜造成刺激，呈充血、水肿的状态。
在射精过程中尿道黏膜以及括约肌会发生剧烈收缩，物理性作用下导致精液速度加快，精液刺激尿道黏膜，射精的过程中尿道有烧灼感，伴有尿频、尿急、尿痛的现象，可伴有腹部坠胀感以及尿不尽感。
当机体出现射精时尿道有烧灼感时，及时去医院进行前列腺液常规、尿常规检查，如果男性患有尿道炎，近期内避免进行性生活，防止炎症对尿道造成持续性刺激，导致症状加重。
并且炎症发生期间多喝水，有助于黏膜分泌物和炎症的清除，并且要在医生指导下服用相应抗炎类药物对症治疗。