病毒性角膜炎的治疗方案是针对抗病毒的治疗为主。抗病毒的治疗药物，临床上常使用的是更昔洛韦凝胶或阿昔洛韦眼药水。病毒的复制有一定的时间限制，不像细菌复制的那么快，病毒感染的药物不用频点，每天的使用四次左右就可以覆盖病毒复制的情况，即每天需要使用更昔洛韦凝胶或阿昔洛韦药水四次左右。病毒性的角膜炎首要的是定期进行复查，至少每周复查一次观察角膜的病变情况。如果有明显的好转迹象就继续的用药，继续的随访。如果病毒的程度明显加重，可能需要调整用药或进行一定的口服、静脉滴注才可以。有些病毒感染的在三周左右，引起角膜上皮下的免疫反应性物质沉积，需要加用激素类的药物进行吸收。如果是激素的药物使用比较及时，大部分在一到两周沉积物也会逐渐消失掉。